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產品中心

KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒

  • 型   號:KK4960
  • 價   格:

產品名稱:KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒
產品貨號:KK4960
產品規格:300反應

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產品介紹: 

  KAPA hgDNA定量&QC試劑盒,是基于SYBR Green I染料法優化的高質量qPCR檢測試劑盒,包含KAPA SYBR® FAST qPCR Master Mix預先稀釋的一系列DNA標準品,以及針對于人類基因組單拷貝的高度保守區域的不同位點所設計的引物預混液。最小片段所對應的引物,用于獲得絕對定量的結果,而額外的引物,用于獲得在DNA樣本中可擴增模板量(質量高的核酸片段)的信息。這個試劑盒由此所產生的質量分數(即Q-ratios),可以用于預測文庫的產量,或者對于如FFPE DNA這類樣本質量變化很大的樣本的工作流程進行調整。


產品名稱:KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒

產品貨號:KK4960


產品特點:

在單次檢測中,同時評估樣本量以及樣本質量

可以將質量分數(Q-ratios)與測序相關指標相關聯

高性能的KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix

預先稀釋好的DNA標準品以及可以直接使用的引物

多功能、易于自動化的工作流程


產品原理:

一組DNA標準品,使用三對不同引物,用于產生(最多)三組標準曲線。這三對引物的擴增目標,位于某高度保守、單拷貝的人類基因組位點,其大小分別為41 bp, 129 bp以及305 bp。41 bp檢測用于DNA樣品的絕對定量。對于評估DNA質量,使用129 bp和/或305 bp引物預混液生成標準曲線并且檢測樣本。由于低質量的DNA樣本的長片段擴增效率會大幅度降低,相對的DNA質量可以通過41 bp檢測的濃度,對于129 bp或者305 bp檢測的濃度進行均一化,或者在此DNA樣本中可被擴增的物質的量來進行推測。這種通過標準化產生的質量分數(值介于0和1之間),可以用于指示DNA的質量,或者在此DNA樣本中可被擴增的物質的量。


產品優勢:

對于稀釋后的DNA樣本進行絕對定量

用附加的引物進行定量分析,獲得的Q-ratio用于指示樣本的質量1.png

使用預期:

文庫的轉化率,為在Illumina測序平臺上進行靶向重測序而制備

分別從樣本質量參差的80-100 ng FFPE DNA樣本(橙色)和商用人類基因組DNA(灰色),使用KAPA LTP文庫構建試劑盒來構建測序文庫。FFPE DNA樣本在用Covaris打斷之前,用KAPA hgDNA定量&QC試劑盒進行檢測,然后按照Q-ratios(DNA質量)沿X軸升序排列。Q-ratios如圖中標注。片段化的DNA(平均大小在180 bp左右)在建庫之前,用Qubit® HS dsDNA (Life Technologies) 進行定量;在連接接頭、形成文庫分子之后,使用基于qPCR的KAPA文庫定量試劑盒進行定量。結果顯示,FFPE樣本的文庫轉化率(Conversion Rate,起始DNA分子轉化成連接有接頭的文庫分子的百分比,%)明顯低于高質量的DNA樣本,使得FFPE樣本的文庫分子多樣性受到限制,并且需要在文庫擴增步驟中采取更多的循環數才能得到足夠多的文庫分子進行靶標捕獲,從而使FFPE樣本的文庫的重復率(duplication rate) 更高,靶標覆蓋率(target coverage)更低。


產品名稱:KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒

產品貨號:KK4960


產品訂購信息

品牌     貨號             名稱                                   規格

KAPA  KK4960  KAPA hgDNA定量和質控試劑盒   300反應


關于公司:

Kapa Biosystems位于美國馬薩諸塞州威爾明頓,是一家蛋白質工程專家及基因組學工具供應商,致力于研發、生產下一代測序(NGS)所需的生物酶及相關試劑,該公司基于直接分子進化平臺開發的產品已被廣泛用于DNA擴增、測序、基因組學研究、分子診斷等領域。


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